SCS验厂和GSV反恐认证都是反恐验厂的一种形式，但它们之间存在一些主要的区别：

1、发起方：GSV是由Intertek天祥集团开发的全球供应链安全验证项目，而SCS是由沃尔玛根据美国反恐组织联盟C-TAPT开发的一套适合沃尔玛自己供应商反恐标准。

2、执行主体：GSV只能由ITS独家进行审核，而SCS则不一定，有可能是ITS验厂，也有可能是其他公证行执行评估。

3、认证内容：GSV和SCS的验厂内容都参考了C-TPAT标准，但SCS在GSV的基础上增加了一些关键点，如公司概况、供应商评估、贸易伙伴、物流和供应链、内务操作、物理安全、程序安全、人员安全、培训等。

4、有效期和分数：GSV和SCS的审核结果都是打分制，GSV的分数在71分以上即可通过，而SCS验厂一般71分为通过，但如果在审核中10个关键点的任何一个出现问题，即使达到71分结果也是不通过。

5、接受方：GSV曾一度成为中国供应商出口美国必备的一块敲门砖，而SCS是沃尔玛反恐验厂标准之一。

总的来说，GSV和SCS都是反恐验厂的一种形式，但它们的发起方、执行主体、认证内容、有效期和分数以及接受方都存在一些区别。