·FSSC 22000 V6.0取消了A类（农业）和FSSC 22000-质量的认证方案，增加了C0（动物初级转化）和FII（贸易和经纪）的认证类别，合并了GI和GII为G类，调整了其他类别和子类别的划分，以符合ISO 22003-1:2022的要求。

·FSSC 22000 V6.0重新计算了审核持续时间，增加了非现场活动、多场所认证抽样、信息及通讯技术（ICT）使用等方面的规定，修改了审核文件和证书的设计和内容，以提高审核的效率和质量。

·FSSC 22000 V6.0增加了对认证机构的要求，包括遵守FSSC道德规范、参加FSSC活动、培训和评估审核员和其他人员的能力、扩展认可范围等，以保证认证的一致性和可信度。

·FSSC 22000 V6.0增加了对食品链组织的要求，包括食品安全和质量文化、质量控制、食品防御、食品欺诈、食品损失和浪费、沟通要求等，以强化食品安全管理体系的有效性和适应性。